1、知識產(chǎn)權(quán)技術(shù)含量不高

實用新型專利通過的周期為一年左右，發(fā)明專利通過的周期更長，要1年半到3年。大多數(shù)知識產(chǎn)權(quán)數(shù)量不夠，又急于申請高企的企業(yè)想保證“擁有自主知識產(chǎn)權(quán)”項加分最快捷的辦法就是選擇軟著申請。企業(yè)純粹為了申報高企而申請軟著，知產(chǎn)關(guān)聯(lián)性低，甚至軟著與研發(fā)項目和產(chǎn)品的關(guān)鍵技術(shù)完全不搭界，張冠李戴，這就導致企業(yè)知識產(chǎn)權(quán)評分不高。

2、科技成果與產(chǎn)品關(guān)聯(lián)性低

新的工作指引中對科技成果轉(zhuǎn)化能力的打分是由技術(shù)資深顧問對企業(yè)科技成果轉(zhuǎn)化的總體情況進行綜合評價，沒有明確統(tǒng)一的衡量標準，對企業(yè)來說，成果轉(zhuǎn)化多多益善是一方面，成果與產(chǎn)品之間的關(guān)聯(lián)與有效轉(zhuǎn)化也是高分的重點。

技術(shù)成果是什么，怎么轉(zhuǎn)化的，應(yīng)用在哪個產(chǎn)品中，應(yīng)用的效果如何，是否產(chǎn)生收益等這都是企業(yè)需要詳盡描述的要點，部分企業(yè)“強行轉(zhuǎn)化”，知產(chǎn)跟項目和產(chǎn)品嚴重不匹配，成果與產(chǎn)品幾乎無關(guān)聯(lián)，那任你舌燦蓮花也無濟于事。

3、人事、財務(wù)等管理制度存在漏洞

新的工作指引加強了企業(yè)對人員社保以及個稅繳納情況的檢查力度，企業(yè)人員既要交社保同時也要繳納個稅。而不少新成立的公司為了節(jié)省費用，往往核心創(chuàng)業(yè)人員甚至初創(chuàng)團隊的員工都不交社保，將錢省下來用于產(chǎn)品研發(fā)、生產(chǎn)、銷售。

此外，近兩年新成立的企業(yè)多以技術(shù)人才創(chuàng)辦為主，這類企業(yè)技術(shù)方面比較領(lǐng)先，但財務(wù)管理方面就相對松散。由于線上支付的發(fā)展，現(xiàn)在很多企業(yè)線上收款，直接進入賬戶，即使進入公司賬戶也很少開票，導致賬目混亂。

在后補充材料中常常容易出現(xiàn)制度寫明了有具體金額的獎勵激勵，但沒有發(fā)獎金、匯款或現(xiàn)金簽收的憑證等前后不一致的現(xiàn)象，使審核資深顧問對其各項管理制度存疑，導致扣分。

4、團隊缺乏申報資料編寫經(jīng)驗

對于中小型企業(yè)和初次申報的企業(yè)來說，對具體政策和申報過程不夠透徹以及編寫申報材料經(jīng)驗不足也是一大難關(guān)。團隊缺乏實操經(jīng)驗，不清楚材料具體應(yīng)該怎么準備，比如：研發(fā)人員不清楚研發(fā)項目怎么歸集，缺乏科學的設(shè)計和安排，照搬專利說明書；財務(wù)人員未設(shè)置研發(fā)支出輔助賬，數(shù)據(jù)前后不一致，企業(yè)審計報表與納稅申報表不一致未做說明；另外技術(shù)性不強，產(chǎn)品描述不清，科技成果佐證材料過于簡單，也會造成資深顧問判斷認定不精準，影響申報結(jié)果。